Farmaceuci nie mają obowiązku sporządzania protokołów wykonania leków recepturowych, ale istnieją zalecenia w tym zakresie, mające na celu zapewnienie jakości sporządzanych leków.
Protokół sporządzania leku recepturowego zawiera informacje dotyczące apteki, pacjenta, numeru kontrolnego leku, daty sporządzenia oraz składników recepturowych użytych do sporządzenia. Protokół musi również zawierać obliczenia niezbędne do sporządzenia leku, opis czynności wykonanych podczas sporządzania, datę przydatności leku, warunki przechowywania, wyniki oceny organoleptycznej i kontrolę wydajności.
Protokoły sporządzania leków recepturowych muszą być podpisane przez osobę wykonującą lek i przechowywane w aptece przez okres 5 lat.