Apteka jest zobowiązana prowadzić ewidencję leków recepturowych, leków aptecznych i produktów leczniczych homeopatycznych, które są w niej sporządzane. Ewidencja ta może być prowadzona w postaci elektronicznej, ale nowością jest to, że wówczas każdy wpis będzie wymagał złożenia kwalifikowanego podpisu elektronicznego. To z kolei będzie wymagało od podmiotów prowadzących apteki zaopatrzenia personelu w odpowiednie narzędzia pracy.